1956年12月26日,成立常州市中医医院,院址在老城区一角,青山桥南,前临北直街,后依天皇堂弄的一个狭小区域。
1958年1月,我院开办时珍国药厂,时有工作人员5人,手工操作为主。
1958年3月,在青山桥西南侧,建成两层水泥砖木结构门诊楼一栋,建筑面积992.2平方米。
1964年10月,在门诊大楼西侧建造两层水泥砖木结构病房楼一座,建筑面积1270平方米。次年7月 ,投入使用。设正规病床100张。
1966年10月,医院更名为常州市第五人民医院。1970年4月25日,医院被迫撤消。
1975年10月,常州市委和市革委会决定恢复常州市中医医院,并由卫生局成立复院筹备小组,羊琪任复院筹备组组长,负责医院筹建工作。
1977年3月15日,医院复院,正式开诊。
1981年,根据市政府规划与部署,医院搬迁至麻巷(原常州市第三人民医院旧址,现址和平南路156号)。设3个病区,开放床位150张。
1983年12月,改扩建原门诊楼为病房楼,新增病房面积1816平方米,共设六个病区,新增病床126张。
1986年2月,药剂楼开工建设。面积3296平方米,共七层,用作制剂加工、中西药配方、中西药库、药检室、药剂行政办公。
1987年9月30日,据常卫办[87]第187号文,成立常州市中医研究所。
1996年底,医院通过江苏省三级甲等综合性中医医院的验收评审。病房大楼的竣工、启用。
1998年6月18日,成立北环街道社区卫生服务中心(常州市中医院北环门诊部)。
2001年,附院挂牌——南京中医药大学附属常州医院。
2004年3月12日,常州市天宁区同济医院成建制划归常州市中医医院,成立常州市中医院南院。
2005年12月23日,举行门诊病房综合楼开工典礼。
2008年6月17日,市长王伟成签署第八号市长办公会议纪要,正式确认我院与钟楼区医院、常州市口腔医院整合。
2009年2月,本院晋升为正处级单位。
2010年6月23日,门诊病房综合楼投入使用。
2011年1月11日,市长王伟成、南京中医药大学校长吴勉华、人大常委会副主任赵忠和、院长张琪为新大楼启用揭幕。
2011年2月24日,国家中医药管理局副局长于文明来院视察。
2012年8月,我院高分通过国家中医药管理局三级中医医院等级评审。
2012年8月,我院院训“精诚守和”荣获中华中医药学会中医药标志性文化作品二等奖。
2013年7月30日,国家级孟河医派传承工作室落户我院。
2013年11月29日,与美国加州中医药大学签订孟河医学流派学术传承合作协议。
2013年11月30日,成功举办第二届孟河医派国际高峰论坛,中共常州市委书记阎立,江苏省卫生厅副厅长、中医药局局长陈亦江、常州市副市长张云云、常州市政协副主席、市卫生局局长陈建国出席了开幕式。
2014年10月,开通“掌上常中医”、“掌上口腔”服务,简化了就医流程,提高就诊效率,有效缓解了“看病难、就医烦”问题。
2014年10月,在全国第二届医院品管圈大赛中喜获三等奖。
2015年2月,承办华东片区中医药传统知识保护工作交流会。
2018年,升格为孟河医学研究院。
2019年12月17日, 急诊病房综合楼落成。
2020年06月06日,急诊病房综合楼全面运营。
2021年9月,成功创建老年友善医院,文件当年12月31日下发。
2021年10月,成为江苏省中医药贸易服务基地。
2021年10月16日,第17期援马耳他医疗队正式出发,开展为期一年的援外医疗工作。
2021年10月20日,常州市中医医院成为常州市中医惠乔基地。
2021年10月23日,由我院承办的“孟河医派传承与创新高峰论坛暨世界孟河医派发展联盟启动仪式”隆重举行。
2022年9月3日,召开首届龙城中医康复论坛暨常州市中医康复专科联盟、质控中心成立大会。
2022年12月20日,配合市疫情防控指挥中心为全市老年人加工发放宣肺清热汤88万人份,共3555152袋。